We wrześniu 2006 roku w Warszawskim Seminarium Teologicznym powstał Instytut Studiów Żydowskich.

Dyrektorem instytutu został dr Sławomir Witkowski.

Celami Instytutu są:
- Badania naukowe nad dziejami i kulturą Żydów w Polsce.
- Badania naukowe na temat relacji chrześcijan z Żydami na przestrzeni wieków (łącznie ze znaczeniem Judaizmu dla teologii chrześcijańskiej - teologia katolicka i Kościołów protestanckich).
- Współpraca z naukowymi ośrodkami zajmujących się badaniami nad dziejami Żydów
- Współpraca z gminami żydowskimi w Polsce.
- Współpraca z organizacjami żydowskimi w Europie i USA
- Propagowanie idei tolerancji i szacunku do wyznawców judaizmu.
- Walka z przejawami antysemityzmu poprzez szerzenie wiedzy o dziejach i kulturze Żydów na ziemiach polskich.
- Prowadzenie warsztatów i szkoleń dla nauczycieli jak nauczać o dziejach Żydów na ziemiach polskich.

Pierwszą inicjatywą Instytutu była organizacja Wieczoru Kultury Żydowskiej, który odbył się 20 września 2006 w Zamku Sieleckim w Sosnowcu. Impreza cieszyła się dużym zainteresowaniem,. Główną atrakcją był świetny występ zespołu Jarmula Band, który przez blisko 2 godziny wykonywał muzykę żydowską. Jeszcze w końcu września Instytut zorganizował konkurs wojewódzki dla szkół gimnazjalnych i ponadgimnazjalnych, poświęcony dziejom Żydów na Śląsku i w Zagłębiu Dąbrowskim. Odbywa się on w trzech etapach, a jego finał będzie mieć miejsce w Centrum Sztuki - Zamek Sielecki w Sosnowcu w marcu 2007 roku.
Kolejną inicjatywą Instytutu była akcja sprzątania cmentarzy żydowskich w Sosnowcu i Będzinie. Uczestniczyła w niej 140 osobowa grupa młodzieży ze szkół gimnazjalnych i średnich z Sosnowca i Będzina. Młodzież pięknie pracowała, szczególnie na XVIII wiecznym cmentarzu w Sosnowcu - Modrzejowie (powstał w 1790r).. Kirkut ten bowiem był całkowicie porośnięty i zaniedbany. Po 6 godzinach pracy przywrócono mu jego dawny wygląd. Młodzież podnosiła przewrócone przez wandali macewy, a nawet usuwała szczątki ludzkie, które zostały odkryte w wyniku dewastacji cmentarza przez wspomnianych już chuliganów.

Akcje te będą powtarzane cyklicznie na przełomie kwietnia/maja. Instytut nawiązał współpracę z katowicką Gminą Żydowską. W przyszłym roku młodzież z WST będzie także sprzątała wybrany cmentarz żydowski w Warszawie.
Dużym przedsięwzięciem będzie również kurs pt. ''Czego i jak nauczać o dziejach i kulturze Żydów na lekcjach historii, języka polskiego i wiedzy o kulturze''. Kurs odbywa się w sosnowieckim Zamku Sieleckim od stycznia do maja 2007 r. w wymiarze 40 godzin. Wykłady będą prowadzić wybitni specjaliści z dziedziny dziejów i kultury żydowskiej w Polsce.
Efektem działalności naukowej było także napisanie dwóch publikacji naukowych, które otrzymały pochlebne recenzje wydane przez wybitnych naukowców z Katedry Judaistki Uniwersytetu Jagiellońskiego. Pierwsza z nich pt. ''Z dziejów Żydów w Zagłębiu Dąbrowskim'', zostanie wkrótce wydana przez Muzeum w Sosnowcu; druga pt ''Żydzi na ziemiach polskich w średniowieczu z uwzględnieniem Śląska i Pomorza Gdańskiego'' zostanie wydana przez Drukarnię Akademicką w Krakowie.
Na zakończenie chciałbym podkreślić wielkie błogosławieństwo Boże, które widzę w tych przedsięwzięciach. Towarzyszy mi wielka radość i satysfakcja kiedy podejmuję wysiłki mające na celu walkę z przejawami antysemityzmu i wszelkimi uprzedzeniami do narodu wybranego. Wierzę, że Instytut stanie się wielkim błogosławieństwem Warszawskiego Seminarium Teologicznego i w przyszłości zaowocuje dalszymi przedsięwzięciami.